Инновационная деятельность в нашей стране еще не подкреплена должным правовым регулированием. Нет единого законодательного акта, содержащего понятийный аппарат и порядок осуществления инновационной деятельности.
Правовой базой инновационного процесса в настоящее время является законодательство в области науки, интеллектуальной собственности и информации. В соответствии со ст. 71 Конституции РФ правовое регулирование интеллектуальной собственности находится в ведении Российской Федерации. Приняты специальные законы, определяющие правовой режим изобретений, полезных моделей, промышленных образцов, электронных документов, объектов авторского права, программ для ЭВМ и баз данных, топологий интегральных микросхем, товарных знаков, знаков обслуживания, наименований мест происхождения товаров.
Вместе с тем специальное законодательство в данной сфере предстоит еще развивать, так как правовой режим некоторых объектов недостаточно сконструирован и регулируется нормами общего законодательства (например, фирменное наименование, коммерческая тайна) или вообще не определен российским законодательством (например, инновации, методы, рационализаторские предложения, «ноу-хау» и т.д.).
Следует отметить, что в данной области действуют множество подзаконных нормативных актов, в основном, актов Российского агентства по патентам и товарным знакам (ранее Комитета РФ по патентам и товарным знакам). Кроме того, данные отношения регулируются международными договорами и соглашениями (Парижская конвенция по охране промышленной собственности, Евразийская патентная конвенция и др.).
Следует иметь в виду, что законодателем по-разному решен вопрос о моменте возникновения и основаниях охраны объектов интеллектуальной собственности и приравненных к ним по правовому режиму 
средств индивидуализации. Можно выделить три системы правовой охраны:
1)регистрационная система — действует в отношении тех объектов, у которых на первое место выдвигается содержательный элемент творчества: изобретений, полезных моделей, промышленных образцов, фирменных наименований, товарных знаков и др. Поскольку это не уникальный результата творчества, он может быть повторен, поэтому для возникновения правовой охраны необходима формализация. Чтобы закрепить право на такие объекты, необходимо провести экспертизу, издать специальный акт государственного органа (зарегистрировать), выдать правоустанавливающий документ (патент, свидетельство);
2)созидательная система — заключается в том, что право на данные объекты возникает в силу самого факта создания, придания объективной формы, а правовая охрана — с момента создания. Данная система правовой охраны применяется в отношении объектов авторского права;
3)система конфиденциальности — основанием охраны является факт организации коммерческой тайны и защиты от неправомерного вмешательства третьих лиц. Эта система применяется, например, для охраны «ноу-хау». К «ноу-хау» относится не защищенная охранными документами и не опубликованная полностью или частично производственная, техническая, организационная или коммерческая информация, процесс разработки которой и дальнейшее использование составляют секрет фирмы, обладатель которой имеет право на защиту от незаконного использования этой информации третьими лицами.
Также подзаконными актами разного уровня регулируются отдельные аспекты инновационной деятельности организации. Например, постановлением Госкомстата РФ от 3 августа 1998 г. № 80 утверждены форма федерального государственного статистического наблюдения за технологическими инновациями предприятия (организации) и инструкция по ее заполнению.
В настоящее время разрабатываются и внедряются программы страхования финансовых рисков при реализации инновационных проектов и создания государственной информационной системы, обслуживающей инновационную деятельность.
В современной России необходимо создать правовую базу и экономические условия, при которых научным организациям, исследовательским центрам, ученым было бы выгодно доводить свои разработки до опытных образцов. Для этого при лабораториях и крупных организациях необходимо создавать малые предприятия и получать венчурное финансирование. Примерно такая схема позволила вырастить вокруг Стенфордского университета «Силиконовую долину».